More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1668 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 437 aa  876    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  53.49 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 		 450 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.35 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.13 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 		 452 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  42.22 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 449 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 450 aa  298  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.91 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.87 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 450 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 		 449 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 		 467 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  38.64 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.52 
 
 		 470 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  40.25 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.03 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 489 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  37.91 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  40.1 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 		 484 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 		 472 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  37.09 
 
 		 460 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  38.66 
 
 		 468 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 478 aa  265  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  37.32 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  37.09 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 463 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37.08 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 		 463 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 		 464 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.46 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.23 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  33.49 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  36.85 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  32.24 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  32.24 
 
 		 451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.41 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  34.65 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  32.24 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  36.05 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>