More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1456 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  100 
 
 
322 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  40.39 
 
 
282 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  41.63 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  43.08 
 
 
324 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  38.19 
 
 
339 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  52.05 
 
 
382 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.61 
 
 
283 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  37.25 
 
 
270 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  39.34 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  51.27 
 
 
312 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  50.32 
 
 
314 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  39.22 
 
 
332 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  50 
 
 
279 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  41.49 
 
 
341 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.48 
 
 
286 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50.97 
 
 
315 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  52.38 
 
 
314 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
342 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  58.68 
 
 
367 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40.89 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  39.69 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  39.61 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  52.76 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  58.54 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  46.11 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.98 
 
 
342 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.22 
 
 
281 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  39.06 
 
 
238 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.87 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  47.8 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  41.53 
 
 
474 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  42.92 
 
 
342 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  39.83 
 
 
335 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  48.52 
 
 
468 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  36.63 
 
 
259 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  43.15 
 
 
297 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  49.11 
 
 
455 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  51.49 
 
 
239 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
284 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  35.12 
 
 
333 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  43.32 
 
 
325 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  59.65 
 
 
249 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  41.43 
 
 
337 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  41.71 
 
 
364 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  55.28 
 
 
275 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  55.28 
 
 
275 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.28 
 
 
266 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  42.25 
 
 
364 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  39.61 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.41 
 
 
265 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  35.86 
 
 
243 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
322 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  38.39 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  39.15 
 
 
254 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50.36 
 
 
442 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  38.04 
 
 
295 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  36.04 
 
 
320 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
279 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  34.42 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  41.85 
 
 
321 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
346 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  36.33 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  37.65 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  53.91 
 
 
286 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  39.81 
 
 
260 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  40.61 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  38.61 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  45.78 
 
 
417 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45.78 
 
 
415 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.42 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  36.07 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  40.62 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  41.81 
 
 
421 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  27.39 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  52.46 
 
 
383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  41.71 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  34.47 
 
 
246 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  34.89 
 
 
394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  44.97 
 
 
394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  41.81 
 
 
419 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  43.67 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  62 
 
 
303 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  51.75 
 
 
269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  50.76 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  37.43 
 
 
293 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.33 
 
 
267 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  35.89 
 
 
249 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  36.44 
 
 
290 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  56.64 
 
 
391 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  52.25 
 
 
267 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  52.63 
 
 
240 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  41.3 
 
 
270 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  57.94 
 
 
370 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
278 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.83 
 
 
333 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  53.91 
 
 
273 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
262 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  38.3 
 
 
277 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  37.75 
 
 
331 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  52.46 
 
 
260 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>