More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0523 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  52.78 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  57 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00326  cytochrome C4  58.43 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  56.25 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  49.48 
 
 		 206 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1635  putative cytochrome  50 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  0.477632 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  49.43 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0946  cytochrome c class I  48.45 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  50.6 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2100  cytochrome c class I  41.59 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2370  cytochrome c, class I  48.45 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2331  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2354  cytochrome c class I  47.42 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2250  cytochrome c class I  48.45 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.792334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1616  cytochrome c class I  46.39 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.016754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5673  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  47.87 
 
 		 219 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1719  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  46.81 
 
 		 219 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  44.04 
 
 		 220 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  48.1 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0999  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  49.04 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.209116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0930  cytochrome c class I  39.5 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0865  cytochrome c class I  42.7 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394911  normal  0.438525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  46.88 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  44.9 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 221 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 221 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  43.27 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  45.68 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  44.21 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  45.1 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  44.66 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  40.21 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.86 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0935  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  41.82 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  41.84 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  46.34 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  47.76 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  38.61 
 
 		 193 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  36.28 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  41.46 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.33 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1232  cytochrome c class I  45.56 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.730475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.79 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  41.84 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 206 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  40.21 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  39.39 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.56 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  43.62 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  43.06 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  41.46 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  35.19 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  40.51 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  35.78 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  39.71 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  44.78 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  35.58 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.58 
 
 		 198 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  39.73 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  39.71 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  41.18 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1233  cytochrome c class I  39.74 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911336  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  33.64 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  38.14 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  33.64 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1072  cytochrome c553  41.18 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.538556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>