More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0002 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  327  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  51.7 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.57 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  36.94 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  29.81 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  29.81 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  26.24 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  24.82 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  26.11 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  28.08 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  25.64 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  25.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  27.7 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  27.52 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  27.52 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  27.52 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  27.52 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  27.89 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>