264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5239 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  92.41 
 
 		 220 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  92.41 
 
 		 220 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  77.86 
 
 		 240 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  58.57 
 
 		 316 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  49.43 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  44.27 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  42.63 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  47.1 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 234 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  46 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  43.45 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  45.39 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  45.95 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  42.36 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  47.26 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  41.3 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.01 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  43.42 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 		 334 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  39.07 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  37.06 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  49.32 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  47.3 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  45.21 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  32.05 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  46.05 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 144 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  34.46 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  34.46 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  43.06 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  45.33 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  34.52 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  30.28 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>