More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2403 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
135 aa  269  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.91 
 
 
134 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  56.59 
 
 
134 aa  155  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.25 
 
 
136 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  59.09 
 
 
135 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.03 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.73 
 
 
135 aa  150  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.47 
 
 
134 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.34 
 
 
134 aa  146  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.03 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 
135 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.64 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55340  transport protein ExbD  47.11 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4816  transport protein ExbD  47.11 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.63 
 
 
141 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2198  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.95 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.16 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.95 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  35.07 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  36.09 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  29.37 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  33.33 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  35.34 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  35.34 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  34.78 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  31.78 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  28.57 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  30.23 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  30.23 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  32.8 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  30.77 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  32.26 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.79 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  33.81 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.01 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  28.46 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  31.54 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>