More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0331 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 344 aa  707    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  79.04 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.08 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  43.29 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.47 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.32 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  43.52 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.45 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.32 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.17 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  42.86 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.77 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.89 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  43.2 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.68 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.36 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.51 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.01 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  45.43 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  42.77 
 
 		 382 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  43.08 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.98 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.6 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  40 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.48 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.34 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  45.51 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.27 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  42.54 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  42.59 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.41 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.98 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.3 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.21 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.28 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  42.37 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.38 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  42.82 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  42.72 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  39.77 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  40.63 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  45.71 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.71 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  43.11 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.83 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  41.23 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  43.4 
 
 		 356 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  42.33 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.46 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  42.72 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  43.71 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  43.52 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  42.33 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  41.59 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.41 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.19 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  41 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.96 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.37 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  43.06 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.55 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  40.19 
 
 		 350 aa  258  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.37 
 
 		 369 aa  258  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.71 
 
 		 340 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.56 
 
 		 382 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  44.06 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  44.06 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.54 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  42.99 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.95 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  40.11 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  42.81 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  43.3 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  44.13 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  43.03 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  41.4 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  41.04 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  41.43 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  41.04 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.04 
 
 		 360 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>