105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1608 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
492 aa  960  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  48.58 
 
 
504 aa  440  1e-122  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  44.86 
 
 
490 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  46.99 
 
 
481 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 
475 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
470 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 
484 aa  142  1e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 
476 aa  132  1e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
479 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 
480 aa  122  2e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  28.94 
 
 
485 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
490 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 
477 aa  75.5  2e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
499 aa  73.6  7e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.61 
 
 
488 aa  72.4  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
546 aa  71.2  4e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
483 aa  70.1  8e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
512 aa  67.8  4e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
489 aa  67.4  5e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
506 aa  66.6  1e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
500 aa  66.6  1e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  1.00108e-05 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
547 aa  66.2  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
468 aa  63.9  6e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
482 aa  63.5  8e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 
407 aa  63.2  9e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
449 aa  62.4  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.9 
 
 
476 aa  61.6  3e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 
482 aa  61.2  4e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
488 aa  60.1  8e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 
500 aa  58.9  2e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
493 aa  58.2  3e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
583 aa  57.8  5e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
489 aa  57.8  5e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
490 aa  57  7e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.72 
 
 
467 aa  57  8e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
423 aa  57  8e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.95 
 
 
517 aa  56.6  9e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 
446 aa  56.6  1e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
444 aa  56.2  1e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 
444 aa  55.8  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
435 aa  55.8  2e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  1.23579e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
475 aa  55.8  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
478 aa  55.1  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
453 aa  55.1  3e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
495 aa  54.7  4e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
491 aa  53.5  7e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 
471 aa  53.5  9e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
499 aa  53.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 
451 aa  53.1  1e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
499 aa  53.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
444 aa  53.1  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
486 aa  52  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
476 aa  51.2  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
423 aa  51.2  4e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
476 aa  51.2  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
433 aa  50.8  5e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
447 aa  50.8  5e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 
435 aa  50.8  5e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.25854e-05  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
440 aa  51.2  5e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 
506 aa  50.4  7e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  24.78 
 
 
458 aa  50.4  7e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
474 aa  50.4  8e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 
899 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 
492 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
504 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
487 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
487 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  21.64 
 
 
416 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.95 
 
 
524 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
513 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  26.11 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  20.21 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
441 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 
476 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 
488 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 
488 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
427 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 
484 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>