105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1608 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 492 aa  960    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  48.58 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  44.86 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  46.99 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  28.94 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 490 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.61 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.9 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 423 aa  57  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.72 
 
 		 467 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 471 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 486 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 440 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  24.78 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 474 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 		 899 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20.1 
 
 		 482 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 		 487 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  21.64 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.95 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 513 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  26.11 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  20.21 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  26.52 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>