118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2354 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  339  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  59.57 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  62.4 
 
 		 161 aa  170  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  51.37 
 
 		 455 aa  170  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  56.52 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  53.59 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  56.03 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  57.25 
 
 		 152 aa  167  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  56 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  53.52 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  51.45 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  52.74 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  52.21 
 
 		 143 aa  154  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  45.7 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  50.38 
 
 		 146 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  43.66 
 
 		 458 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  47.52 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  45.65 
 
 		 471 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  47.37 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  48.87 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  48.87 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  42.14 
 
 		 456 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  42.55 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  43.88 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  41.43 
 
 		 459 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  44.7 
 
 		 471 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  41.72 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  45.26 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  42.38 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  46.38 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  41.06 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  41.91 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  43.38 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  40.13 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  40.13 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  39.47 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  40.58 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  39.47 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  38.13 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  39.42 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  40.16 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  39.16 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  32.26 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  32.26 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  31.61 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  30.52 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  29.19 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  30.07 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  30.5 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  31.62 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  30.99 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  29.8 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  29.75 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  35.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  29.87 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  28.39 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  29.87 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  28.95 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  28.95 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  31.41 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.47 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  28.08 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  28.39 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  30.07 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  27.52 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  29.84 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  27.97 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  29.73 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  27.56 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  28.8 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  30.32 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  28.46 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  28.29 
 
 		 268 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  26.03 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  31.43 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  26.9 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  32.14 
 
 		 308 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  35.24 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  28.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  24.03 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  30.63 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  24.84 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  24.49 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  28.91 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  25.95 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  24.8 
 
 		 316 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  26.85 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  27.74 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  34.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  21.74 
 
 		 308 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>