156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0028 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  65.62 
 
 		 97 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  62.5 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  61.46 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  66.32 
 
 		 177 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  44.79 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  43.01 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  40.62 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  46.43 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  39.78 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  43.62 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  40.66 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  40.66 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.49 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  41.49 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  38.54 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  45.56 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  43.18 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  43.82 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  43.59 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  44.19 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  44.58 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  38.54 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  40.45 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  34.02 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  38.82 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.41 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  43.42 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  44.87 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  30.93 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  45.57 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  43.28 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  33.67 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  43.42 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.1 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.29 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  41.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.74 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  41.67 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  38.24 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  43.08 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  34.67 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  36.78 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  31.96 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  34.38 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  43.84 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  38.46 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  41.25 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  43.21 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  48.33 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  35.63 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>