More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf347 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  100 
 
 		 612 aa  1236    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  40.06 
 
 		 598 aa  231  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.54 
 
 		 601 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  38.55 
 
 		 605 aa  218  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  38.55 
 
 		 605 aa  218  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.12 
 
 		 611 aa  217  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  33.93 
 
 		 602 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  35.47 
 
 		 579 aa  216  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.7 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  38.39 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.75 
 
 		 587 aa  213  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  34.58 
 
 		 594 aa  213  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  35.55 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.28 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  33.61 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.33 
 
 		 598 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  31.77 
 
 		 576 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  32.61 
 
 		 625 aa  211  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  38.32 
 
 		 617 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  33.86 
 
 		 550 aa  210  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  29.71 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  34.86 
 
 		 640 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.16 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.85 
 
 		 640 aa  207  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.19 
 
 		 626 aa  206  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.68 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  35.67 
 
 		 604 aa  206  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.68 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  27.24 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.57 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  37.25 
 
 		 560 aa  203  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  32.18 
 
 		 655 aa  203  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  32.46 
 
 		 621 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  32.98 
 
 		 664 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  32.98 
 
 		 663 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.18 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  33.87 
 
 		 651 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.03 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.07 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  35.96 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.07 
 
 		 574 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  33.44 
 
 		 642 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  32.71 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  33.6 
 
 		 652 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  32.71 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  29.96 
 
 		 604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  35.31 
 
 		 627 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  35.31 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  30.49 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  32.71 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  32.71 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  32.71 
 
 		 581 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  32.51 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  32.82 
 
 		 574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  35.25 
 
 		 610 aa  200  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.3 
 
 		 614 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  32.82 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl269  DNA primase  36.86 
 
 		 626 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  33.33 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.59 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  32.52 
 
 		 584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  31.62 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  30.93 
 
 		 655 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  32.25 
 
 		 584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  32.53 
 
 		 660 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  34.47 
 
 		 625 aa  198  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  31.61 
 
 		 656 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  36.03 
 
 		 634 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  32.8 
 
 		 575 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  31.71 
 
 		 618 aa  198  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  32.89 
 
 		 638 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  32.17 
 
 		 581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  32.53 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  32.93 
 
 		 598 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  32.53 
 
 		 660 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.82 
 
 		 588 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.39 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.02 
 
 		 653 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.24 
 
 		 660 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.18 
 
 		 674 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  32.39 
 
 		 574 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  34.21 
 
 		 606 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  32.39 
 
 		 574 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.88 
 
 		 600 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  32.36 
 
 		 663 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0733  hypothetical protein  32.81 
 
 		 593 aa  196  9e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  31.51 
 
 		 633 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  32.44 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.98 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.63 
 
 		 694 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  32.29 
 
 		 660 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.44 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  32.44 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>