285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1653 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  74.51 
 
 		 513 aa  737    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 513 aa  991    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  75.49 
 
 		 509 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  74.26 
 
 		 513 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  76.08 
 
 		 509 aa  732    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  74.46 
 
 		 511 aa  734    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  85.74 
 
 		 515 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  68.57 
 
 		 508 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  66.27 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  63.6 
 
 		 511 aa  598  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  63.4 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  62.78 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  63.01 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  63.2 
 
 		 511 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  63.99 
 
 		 515 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  62.8 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  62.2 
 
 		 511 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1579  histidine ammonia-lyase  65.67 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179802  normal  0.0722817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  62.11 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  62.17 
 
 		 518 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2935  histidine ammonia-lyase  64.68 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  59.6 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  60.44 
 
 		 513 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  60.97 
 
 		 518 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  60.81 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  57.93 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  61.29 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  60.56 
 
 		 507 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 		 507 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  59.96 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  60.56 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 529 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 529 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  57.55 
 
 		 511 aa  528  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  60.69 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 533 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  58.27 
 
 		 513 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  58.27 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  60.08 
 
 		 514 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  58.27 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  58.06 
 
 		 510 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  58.47 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  58.27 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  58.47 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  55.85 
 
 		 511 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  56.66 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  57.14 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  56.57 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  57.26 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  56.85 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  58.35 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  56.86 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  57.26 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  56.48 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  58.88 
 
 		 507 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  59.28 
 
 		 507 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  58.5 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  56.46 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  55.31 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  59.28 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  56.46 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  54.1 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  58.28 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  55.8 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  59.34 
 
 		 517 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  53.51 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  53.63 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  59.55 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  59.34 
 
 		 518 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  55.86 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  60.32 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  55.86 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  55.67 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5637  histidine ammonia-lyase  57.06 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  55.09 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  55.09 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  55.09 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  55.58 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  55.09 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  58.68 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  58.68 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  55.47 
 
 		 510 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  54.89 
 
 		 506 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5047  histidine ammonia-lyase  57.29 
 
 		 518 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4085  histidine ammonia-lyase  57.46 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0077  histidine ammonia-lyase  57.46 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  59.6 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  55.17 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4137  histidine ammonia-lyase  57.26 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0926785  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  54.44 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  57.17 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5831  histidine ammonia-lyase  57.49 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  57.37 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  58.79 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>