More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0839 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0839  sugar metabolism transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000299847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  53.04 
 
 
251 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  42.39 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  43.67 
 
 
246 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  40.16 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  175  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  39.76 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  39.36 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  39.76 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  39.76 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
248 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 
252 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.79 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
257 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
263 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
253 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
274 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
267 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.27 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
258 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.27 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.27 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.27 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.27 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
288 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.06 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.18 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
252 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
260 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  31.65 
 
 
252 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  31.65 
 
 
252 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.17 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.17 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
252 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 
255 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  31.65 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  31.84 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.71 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
252 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 
260 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
251 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
254 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
252 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  23.39 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
256 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4943  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
254 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 
257 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 
257 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 
257 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
257 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  30.31 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  28.74 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
261 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
261 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
255 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  30.12 
 
 
254 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
261 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
264 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
256 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 
258 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
260 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
256 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.85 
 
 
257 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 
267 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 
267 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  31.02 
 
 
253 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
257 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.84 
 
 
269 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>