71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  42.98 
 
 		 191 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  40.69 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  45.52 
 
 		 162 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  39.24 
 
 		 174 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  41.43 
 
 		 164 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  41.43 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  43.33 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.8 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  43.44 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  42.96 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  42.45 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  40.13 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  39.57 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  43.24 
 
 		 175 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  41.09 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  47.01 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  41.86 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  41.86 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  41.35 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  41.46 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  36.64 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  35.9 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  47.54 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.16 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  35.97 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  37.6 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  34.78 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  31.36 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  39.26 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  32.73 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  35.77 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  37.61 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  29.21 
 
 		 455 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  32.46 
 
 		 466 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  32.46 
 
 		 468 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  32.46 
 
 		 475 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.46 
 
 		 482 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30.1 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  32.46 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  31.58 
 
 		 491 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.58 
 
 		 466 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  31.09 
 
 		 468 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.58 
 
 		 512 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  33.68 
 
 		 439 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  31.58 
 
 		 468 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.09 
 
 		 468 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  31.09 
 
 		 468 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  27.22 
 
 		 402 aa  45.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  32.98 
 
 		 441 aa  45.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  31.58 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  26.4 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  26.4 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  26.4 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  26.4 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.58 
 
 		 470 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30 
 
 		 498 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  25.74 
 
 		 453 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  27.91 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  28.46 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  27.4 
 
 		 465 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  31.33 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  26.8 
 
 		 447 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  26.8 
 
 		 447 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  31.76 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  30.7 
 
 		 472 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  27.91 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  27.91 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  27.91 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  27.91 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.08 
 
 		 462 aa  42  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>