148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1756 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  50.77 
 
 		 824 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  100 
 
 		 880 aa  1796    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  44.2 
 
 		 840 aa  710    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  53.54 
 
 		 846 aa  905    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  51.06 
 
 		 812 aa  826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  44.88 
 
 		 829 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.39 
 
 		 818 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  50.71 
 
 		 831 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.52 
 
 		 817 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  43.3 
 
 		 843 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  46.03 
 
 		 799 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  41.61 
 
 		 843 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.3 
 
 		 845 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  29.99 
 
 		 813 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.91 
 
 		 813 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.58 
 
 		 845 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 786 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  33.49 
 
 		 785 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 793 aa  360  7e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  37.02 
 
 		 833 aa  356  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  37.17 
 
 		 839 aa  354  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  31.1 
 
 		 864 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  32.44 
 
 		 861 aa  345  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.95 
 
 		 842 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  33.88 
 
 		 819 aa  345  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 863 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.82 
 
 		 835 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  31.24 
 
 		 824 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  29.18 
 
 		 875 aa  333  8e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 897 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.02 
 
 		 872 aa  331  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.62 
 
 		 837 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 871 aa  330  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  33.18 
 
 		 823 aa  328  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.86 
 
 		 860 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  31.28 
 
 		 819 aa  318  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 891 aa  316  9e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  31.87 
 
 		 819 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  30.51 
 
 		 837 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  33.18 
 
 		 891 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  31.83 
 
 		 815 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  30.99 
 
 		 838 aa  307  6e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  30.06 
 
 		 802 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  30.6 
 
 		 847 aa  300  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  29.72 
 
 		 802 aa  296  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.67 
 
 		 940 aa  261  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  32.01 
 
 		 663 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  25.29 
 
 		 845 aa  207  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.8 
 
 		 882 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  28.31 
 
 		 882 aa  157  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  25.26 
 
 		 820 aa  157  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  29.56 
 
 		 962 aa  156  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  23.01 
 
 		 821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 		 826 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  27.96 
 
 		 839 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 826 aa  152  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 816 aa  151  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  27.24 
 
 		 839 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  27.24 
 
 		 839 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  27.24 
 
 		 839 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  27.24 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  27.24 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  27.24 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  27.24 
 
 		 839 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.94 
 
 		 878 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.62 
 
 		 971 aa  131  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 853 aa  129  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.44 
 
 		 984 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  27.09 
 
 		 811 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.04 
 
 		 744 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.9 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 906 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  29.89 
 
 		 825 aa  105  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  24.77 
 
 		 856 aa  104  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  26.09 
 
 		 828 aa  104  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  26.09 
 
 		 828 aa  104  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  26.09 
 
 		 828 aa  104  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  28.85 
 
 		 827 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  22.9 
 
 		 1144 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.24 
 
 		 734 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  28.94 
 
 		 812 aa  98.2  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.08 
 
 		 815 aa  97.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.9 
 
 		 720 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 739 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 724 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.15 
 
 		 1362 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.46 
 
 		 905 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.49 
 
 		 1243 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  21.1 
 
 		 1270 aa  65.1  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  23.53 
 
 		 1012 aa  64.3  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.99 
 
 		 892 aa  63.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.35 
 
 		 901 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 		 627 aa  60.1  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  21.96 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.25 
 
 		 1033 aa  57.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  23.06 
 
 		 1008 aa  57.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.92 
 
 		 619 aa  57.4  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 803 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  22.28 
 
 		 972 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>