More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0677 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 431 aa  858    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  42.24 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  43.1 
 
 		 415 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 		 963 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 652 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 687 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  36.99 
 
 		 653 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1682 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  38.23 
 
 		 475 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  40.67 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 774 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  35.1 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 795 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  42.46 
 
 		 1454 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  43.86 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  36.12 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  36.42 
 
 		 322 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  40.18 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  36.12 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  35.91 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.39 
 
 		 2122 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  38.23 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  32.94 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  36.68 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 		 1383 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  33.94 
 
 		 457 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  33.52 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  30.59 
 
 		 514 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  31.48 
 
 		 901 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  31.89 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  32.95 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  33.54 
 
 		 1812 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  31.37 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  33.77 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  33.91 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  34.51 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  30.23 
 
 		 475 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  34.26 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.29 
 
 		 611 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 861 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 		 705 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  31.35 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  31.99 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.9 
 
 		 402 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.57 
 
 		 616 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  30.83 
 
 		 797 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 		 546 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 643 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.59 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  31.17 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  27.4 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.84 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 		 534 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 		 363 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  35.07 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.78 
 
 		 384 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.5 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 		 426 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.41 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 619 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.22 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  30.21 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  28.46 
 
 		 1328 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  27.64 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.11 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.11 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  34.47 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.25 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  29.23 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  28.9 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.82 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  28.62 
 
 		 379 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.38 
 
 		 1241 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.38 
 
 		 475 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  31.52 
 
 		 1311 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.91 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.83 
 
 		 2272 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  28.99 
 
 		 834 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  26.64 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.25 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.71 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>