More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1928 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  100 
 
 
676 aa  1360  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  40.38 
 
 
751 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 
681 aa  271  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.05774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 
706 aa  219  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.64695e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
699 aa  216  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  26.85 
 
 
633 aa  166  1e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.58389e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.71 
 
 
639 aa  164  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
635 aa  154  6e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
653 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
634 aa  148  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
688 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.76 
 
 
663 aa  138  3e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.02 
 
 
666 aa  135  2e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.71 
 
 
640 aa  135  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.15 
 
 
653 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.21 
 
 
659 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  26.06 
 
 
663 aa  134  7e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.76 
 
 
661 aa  134  7e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
648 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.93 
 
 
663 aa  132  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
657 aa  132  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.79 
 
 
663 aa  131  4e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.79 
 
 
663 aa  131  4e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.51 
 
 
666 aa  131  5e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.97059e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 
663 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.79 
 
 
663 aa  130  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.79 
 
 
663 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.29 
 
 
641 aa  130  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 
666 aa  130  1e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 
666 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 
666 aa  130  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.57 
 
 
650 aa  129  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.57 
 
 
650 aa  129  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.32 
 
 
650 aa  128  4e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.25 
 
 
650 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 
694 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.43 
 
 
650 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.32 
 
 
646 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.08252e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.88 
 
 
656 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.75 
 
 
655 aa  123  1e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
698 aa  122  2e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 
628 aa  119  1e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
679 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
707 aa  115  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 
668 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.68 
 
 
744 aa  114  4e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.16 
 
 
744 aa  114  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
652 aa  112  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 
719 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.95 
 
 
652 aa  112  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.07235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.32 
 
 
744 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.71 
 
 
665 aa  110  7e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.71 
 
 
665 aa  110  7e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.58 
 
 
665 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 
650 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.82 
 
 
630 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
617 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 
623 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.77 
 
 
613 aa  107  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
740 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
638 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 
649 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.09269e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  21.69 
 
 
665 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 
739 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.88 
 
 
614 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  8.24718e-11 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.42 
 
 
746 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 
678 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 
661 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
702 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
619 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 
628 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.7 
 
 
614 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.7 
 
 
614 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  1.09547e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.7 
 
 
614 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  2.67555e-08 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  22.91 
 
 
696 aa  99.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  99  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.01627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.87 
 
 
618 aa  98.2  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 
649 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.53 
 
 
614 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.6 
 
 
638 aa  97.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 
624 aa  97.4  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.59 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.09 
 
 
698 aa  96.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.59 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  21.93 
 
 
702 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 
649 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
641 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 
688 aa  94.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  21.19 
 
 
748 aa  94.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 
707 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
715 aa  94.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.97 
 
 
1023 aa  94.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
647 aa  94.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.42 
 
 
614 aa  94  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 
653 aa  94  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  21.73 
 
 
750 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  22.49 
 
 
677 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  23.61 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>