More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1595 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
510 aa  1045    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  41.97 
 
 
769 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 
321 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  40.22 
 
 
792 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  37.22 
 
 
709 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  37.97 
 
 
618 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  39.62 
 
 
717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  38.52 
 
 
773 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  37.59 
 
 
710 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  38.77 
 
 
891 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  36.58 
 
 
629 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  34.13 
 
 
289 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  32.54 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  36.4 
 
 
758 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.14 
 
 
306 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  34.19 
 
 
576 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  34.6 
 
 
289 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  36.67 
 
 
760 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  35.69 
 
 
620 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
279 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 
255 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
224 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
254 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
244 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
244 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
239 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
244 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 
275 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
271 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 
645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  32.51 
 
 
234 aa  110  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 
274 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
266 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
253 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 
233 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 
233 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 
319 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  33.05 
 
 
238 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 
238 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  25.96 
 
 
319 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
278 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  30.39 
 
 
256 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 
249 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 
627 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.62 
 
 
256 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
354 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
336 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
257 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.91 
 
 
318 aa  99  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
316 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
659 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
659 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 
274 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 
660 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 
249 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
239 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.41 
 
 
363 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.47 
 
 
261 aa  94.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
233 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  28.93 
 
 
373 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
615 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
615 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  29.63 
 
 
277 aa  93.6  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1015 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
274 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  31.77 
 
 
348 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
259 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.21 
 
 
239 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
348 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
370 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
251 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
348 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
244 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
348 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 
264 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
357 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  26.09 
 
 
673 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  26.09 
 
 
673 aa  90.1  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  26.09 
 
 
673 aa  90.1  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
348 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  25.71 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
348 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
348 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 
628 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  29.77 
 
 
310 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
348 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.95 
 
 
295 aa  88.2  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  29.77 
 
 
378 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 
349 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  29.77 
 
 
296 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 
258 aa  87.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 
426 aa  87.4  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  29.77 
 
 
395 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  29.77 
 
 
437 aa  87  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>