More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0795 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  59.83 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.75 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  35.27 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.53 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.19 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.04 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  33.77 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  34.48 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  32.88 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.43 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.67 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.67 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  32.54 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  32.54 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  31.22 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.53 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  30.7 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  31.53 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  31.53 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.42 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.82 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  32.29 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.9 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  29.83 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 		 216 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 215 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.22 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  30.81 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  30.81 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  29.6 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.44 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  29.28 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.86 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  29.95 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.37 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.45 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.27 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  27.69 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.22 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.07 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.41 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.53 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  25.99 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  24.23 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.51 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  22.41 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  24.38 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  24.28 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  25.85 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1752  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000718269  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.29 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  23.05 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.75 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  25.75 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2565  HAD family hydrolase  24.6 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000244874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  24.64 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  23.05 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.87 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  22.17 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  23.87 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  23.77 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.23 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  23.79 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  23.3 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  22.61 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  22.61 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  23.32 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  25.7 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  25.56 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.019501  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>