More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0304 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  100 
 
 		 773 aa  1611    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  57.29 
 
 		 768 aa  878    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  40.19 
 
 		 784 aa  492  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  38.76 
 
 		 765 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  38.67 
 
 		 807 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  37.6 
 
 		 833 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.46 
 
 		 821 aa  395  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.8 
 
 		 763 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  37.02 
 
 		 838 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  36.85 
 
 		 821 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 807 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  33.29 
 
 		 727 aa  333  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  35.15 
 
 		 801 aa  330  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  33.2 
 
 		 772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.97 
 
 		 740 aa  325  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  34.33 
 
 		 773 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  33.24 
 
 		 892 aa  323  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 723 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 766 aa  320  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.17 
 
 		 789 aa  317  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  33.63 
 
 		 739 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.38 
 
 		 727 aa  310  8e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.24 
 
 		 744 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.29 
 
 		 759 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.01 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 820 aa  287  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 		 880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 737 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 801 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 1057 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 819 aa  273  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 736 aa  270  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 808 aa  267  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 871 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  31.95 
 
 		 721 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  31.96 
 
 		 771 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.46 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 		 877 aa  251  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 766 aa  246  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  30.66 
 
 		 693 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  31.29 
 
 		 830 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 705 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 816 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 816 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 816 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  31.94 
 
 		 680 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 710 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  30.19 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  30.54 
 
 		 814 aa  233  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 703 aa  229  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  30.71 
 
 		 810 aa  228  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 818 aa  227  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 817 aa  226  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 700 aa  226  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.2 
 
 		 722 aa  225  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 828 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 695 aa  216  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 824 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 761 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 830 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  29.12 
 
 		 723 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  30.89 
 
 		 764 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 831 aa  208  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 831 aa  208  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 		 725 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  27.67 
 
 		 751 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  28.59 
 
 		 704 aa  205  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  28.78 
 
 		 750 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  28.09 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 1065 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  30.52 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  28.73 
 
 		 643 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 840 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  27.2 
 
 		 668 aa  196  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  27.06 
 
 		 839 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.61 
 
 		 829 aa  195  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  28.42 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 626 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 836 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  27.15 
 
 		 752 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  28.46 
 
 		 837 aa  190  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  26.5 
 
 		 755 aa  189  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.6 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  28.36 
 
 		 837 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.02 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  28.88 
 
 		 865 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  28.62 
 
 		 832 aa  189  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 897 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 806 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 806 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 806 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  27.89 
 
 		 708 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  27.07 
 
 		 683 aa  187  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  28.9 
 
 		 683 aa  187  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>