More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1657 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  83.19 
 
 
228 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  77.73 
 
 
229 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  76.86 
 
 
229 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.46 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.35 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.02 
 
 
237 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 
236 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
288 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
246 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  47.56 
 
 
247 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.96 
 
 
239 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
265 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  46.61 
 
 
225 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  46.61 
 
 
225 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.78 
 
 
236 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
232 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
229 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.78 
 
 
226 aa  205  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
256 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  44.09 
 
 
256 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  41.78 
 
 
256 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  45.74 
 
 
249 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
238 aa  205  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.52 
 
 
230 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.89 
 
 
228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.3 
 
 
235 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  50.67 
 
 
279 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
227 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.22 
 
 
242 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
248 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
230 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  47.06 
 
 
249 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  49.32 
 
 
233 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  44.8 
 
 
230 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.6 
 
 
238 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  47.09 
 
 
234 aa  201  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.78 
 
 
236 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
238 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.09 
 
 
232 aa  201  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.75 
 
 
226 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
240 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  46.61 
 
 
241 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
229 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.97 
 
 
225 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.67 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  46.15 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.78 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  49.54 
 
 
258 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.95 
 
 
239 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3462  ABC transporter related  45.33 
 
 
228 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
319 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.58 
 
 
230 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48 
 
 
228 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  50.69 
 
 
235 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.09 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.57 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 
256 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 
226 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  43.56 
 
 
256 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
228 aa  198  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  46.43 
 
 
247 aa  198  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.71 
 
 
219 aa  198  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
230 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  49.55 
 
 
230 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.97 
 
 
227 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  48.9 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
246 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.19 
 
 
241 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  42.53 
 
 
259 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  45.66 
 
 
229 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  50 
 
 
455 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.05 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  48.51 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  43.97 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  44.25 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.95 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.36 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.74 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  43.61 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.75 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>