More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1298 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  59.12 
 
 		 557 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  60.35 
 
 		 557 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1227    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  52.52 
 
 		 570 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  43.87 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  42.04 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  41.12 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  39.92 
 
 		 656 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 575 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 559 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 583 aa  317  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 		 559 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  38.05 
 
 		 590 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  37.8 
 
 		 590 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 		 562 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  36.03 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  36.59 
 
 		 504 aa  242  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  33.67 
 
 		 524 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  31.82 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 551 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 505 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  34.52 
 
 		 530 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  33.55 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  34.1 
 
 		 530 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 		 623 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 625 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  29.16 
 
 		 624 aa  191  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  30.97 
 
 		 609 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 490 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 616 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 646 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 625 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 554 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 437 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.88 
 
 		 674 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.16 
 
 		 472 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 461 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 470 aa  97.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 520 aa  97.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.67 
 
 		 677 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 669 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.3 
 
 		 472 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.6 
 
 		 563 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 502 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 520 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.49 
 
 		 459 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 555 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 564 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 506 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 864 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.82 
 
 		 484 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 506 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.39 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.35 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  29.59 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.34 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.05 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.77 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  21.41 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  22.79 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0261  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  22.16 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  22.16 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  22.88 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  21.22 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  24.23 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>