81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3241 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  42.33 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  41.4 
 
 
196 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  42.31 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  40.22 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  36.5 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  33.33 
 
 
201 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  35.52 
 
 
206 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  37.65 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  33.71 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  35.88 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  35.88 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  29.95 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  27.84 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  32.29 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  31.35 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  34.3 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  34.3 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  34.3 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  34.3 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  34.3 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  34.3 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  34.3 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  33.93 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  37.12 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  32 
 
 
264 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  31.76 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  31.52 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  26.26 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  29.82 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  26.74 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  28.34 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.9 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  24.73 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  30.4 
 
 
241 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  30.28 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  29.51 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  28.88 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  29.5 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  26.82 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  30.57 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  27.61 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  29.41 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  28.35 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  25.27 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  23.76 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  29.2 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  29.2 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  24.87 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  25.24 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  26.2 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  24.76 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  23.5 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  24.46 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  25.56 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  27.69 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  26.53 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4622  hypothetical protein  32.38 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  22.22 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  22.99 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  32.58 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  23.12 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.2 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  23.91 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  28.28 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  22.75 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  22.75 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  29.57 
 
 
236 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  27.22 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  29.1 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  22.36 
 
 
236 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  28.28 
 
 
231 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>