More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2588 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 359 aa  720    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  57.98 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  51.39 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  45.51 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  45.38 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  47.63 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  46.54 
 
 		 360 aa  315  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  35.18 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  28.29 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  27.43 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.56 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  26.76 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  28.21 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  28.12 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.96 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.28 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  27.99 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  25.41 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.58 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  26.47 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  26.23 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  29.48 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  26.61 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  27.41 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  26.79 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  25.73 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  26.79 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.84 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.21 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  26.63 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 391 aa  96.3  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  28.94 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  26.48 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  24.79 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 1040 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  28.25 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  30.17 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  26.74 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  26.17 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.87 
 
 		 384 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  24.37 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  26.2 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  23.41 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25.33 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.03 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.66 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  25.86 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  25.08 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.38 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.74 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.02 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 391 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>