More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1176 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1176  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0442  LysR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0918  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4124  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.175412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2202  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.871962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4033  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2941  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0449  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000587967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1268  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00300028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0530  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.979074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1206  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000040335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2882  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  23.89 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0722  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1994  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.576839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2901  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  37.27 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.32 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.45 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  37.27 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  37.27 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  42.73 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4804  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0414707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0441  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3189  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1372  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0055  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0623  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.6 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0461  DNA-binding transcriptional activator GcvA  27.31 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1623  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  30.61 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3246  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769279  normal  0.647025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_003296  RS01684  DNA-binding transcriptional activator GcvA  26.07 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  21.77 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6097  transcriptional regulator, LysR family  26.2 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0383  DNA-binding transcriptional activator GcvA  26.74 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  24.18 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  26.2 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  44.14 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.89 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  27.96 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  24.18 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  28.64 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2338  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2952  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00119284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>