More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1852 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  62.26 
 
 		 257 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  67.31 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  59.14 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  58.27 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  57.09 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  57.09 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  54.79 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  58.17 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  52.4 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  50.59 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  52.14 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  55.24 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  46.09 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  44.19 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  44.96 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  41.43 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  48.39 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  44.3 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  40.08 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  44 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  42.8 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  40.47 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  41.63 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  40.94 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  40.56 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  43.56 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  39 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  39.37 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  36.47 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  38.4 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  42.75 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  37.11 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.98 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  40.55 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  37.3 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  39.2 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  39.31 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  40.17 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  39.74 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  39.74 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.06 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  39.52 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  38.24 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  38.37 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  38.6 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  40.69 
 
 		 328 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  36.72 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  35.74 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  36.33 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  36.03 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  35.36 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  35.83 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  35.36 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  35.36 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  37.25 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  38.01 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  40.34 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  40.43 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  42.11 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  38.26 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  35.14 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  34.15 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  38.82 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  39.58 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  33.98 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  37.83 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  37.83 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  40.47 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  35.14 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  34.93 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  35.14 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.08 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  42.61 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  37.66 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  33.84 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  32.56 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  39.48 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  36.29 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  32.7 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  40.87 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  34.89 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  33.46 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  34.47 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  35.09 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  38.84 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  34.78 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  36.8 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  35.16 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  35.16 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  36.02 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.46 
 
 		 370 aa  143  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  34.1 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  36.24 
 
 		 377 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  32.81 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>