238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0293 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  42.48 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  42.54 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  42.48 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  42.92 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  41.47 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  34.47 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  38.99 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.4 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.4 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.94 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.8 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.8 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  26.5 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  29.73 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.39 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  24.3 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.8 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.06 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  27.98 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  23.98 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  27.98 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  23.96 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.56 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  28.93 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  29.28 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.34 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  27.48 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  24.68 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25.88 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  25.2 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  26.45 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  29.21 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.9 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  24.67 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  27.75 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  23.87 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  26.13 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  27.93 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  35.16 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  23.89 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28.44 
 
 		 408 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  24.39 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.81 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  22.8 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  28.88 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  26.69 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  27.83 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  29.09 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.78 
 
 		 291 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  30.94 
 
 		 313 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  27.24 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.02 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>