More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3368 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  100 
 
 		 246 aa  500  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  89.84 
 
 		 246 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  44.89 
 
 		 342 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  64.46 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  47.7 
 
 		 346 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  59.84 
 
 		 341 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  58.73 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  46.2 
 
 		 349 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  59.83 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  55.12 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  51.3 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  51.24 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  50.88 
 
 		 424 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  48.7 
 
 		 170 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 391 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  50.45 
 
 		 476 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  48.41 
 
 		 458 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  50.43 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  45.19 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 333 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 183 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  44.25 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  48.67 
 
 		 191 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  44.93 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  49.55 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  40.58 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.86 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.86 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.46 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 192 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  45 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.86 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  50.47 
 
 		 181 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  41.89 
 
 		 154 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  47.75 
 
 		 162 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 164 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.16 
 
 		 207 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  45.08 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 154 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.33 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 147 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  42.75 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  33.71 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.71 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  47.79 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  35.84 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 147 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.74 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  47.27 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.91 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  43.64 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.29 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.29 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.29 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  46.02 
 
 		 169 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  41.89 
 
 		 159 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>