167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2566 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 643 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 596 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  39.33 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  43.96 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  31.73 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  37.36 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2641  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0334  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  40.62 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1124 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  31.53 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4072  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  35.14 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3850  Generic methyltransferase  34.92 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0534  hypothetical protein  43.86 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0749  hypothetical protein  33 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.4749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 194 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.65 
 
 		 764 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1050  hypothetical protein  43.86 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.38 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2283  hypothetical protein  39.71 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0052  hypothetical protein  35.29 
 
 		 172 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000148856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.41 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 511 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  50 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2592  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 201 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  52.08 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1151  hypothetical protein  27.56 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  29.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  52.27 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12981  hypothetical protein  31.17 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  51.11 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.43 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1591  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.88 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.27 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  46.94 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  42.37 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  50 
 
 		 706 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 251 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  53.19 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.94 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  51.06 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  48 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.1 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  44.44 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.57 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.28 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  51.06 
 
 		 711 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  51.06 
 
 		 710 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5204  methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.521724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3961  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0335646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.58 
 
 		 853 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.55 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  30.59 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0671  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  38.82 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  44 
 
 		 802 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1031  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>