More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2854 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  78.33 
 
 
264 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  75.76 
 
 
265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  62.5 
 
 
263 aa  331  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  56.65 
 
 
264 aa  296  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  54.75 
 
 
264 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  57.58 
 
 
262 aa  295  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  54.92 
 
 
265 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  50.76 
 
 
265 aa  285  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  54.55 
 
 
264 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
265 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  53.79 
 
 
267 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  53.99 
 
 
264 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 
270 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  53.79 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  52.27 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  52.47 
 
 
264 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  52.47 
 
 
264 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
267 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  52.09 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  51.14 
 
 
264 aa  265  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
264 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  51.38 
 
 
264 aa  264  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50.4 
 
 
282 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  52.85 
 
 
264 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.38 
 
 
264 aa  262  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  49.42 
 
 
264 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  50.95 
 
 
264 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  49.42 
 
 
265 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  53.23 
 
 
263 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
264 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  50.57 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 
264 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
267 aa  258  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 
264 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  48.86 
 
 
296 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  48.3 
 
 
267 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
270 aa  256  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  50.19 
 
 
264 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  50.95 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  50.57 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
264 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
261 aa  251  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  49.62 
 
 
264 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  49.05 
 
 
264 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
264 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  49 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  46.22 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  46.21 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 
264 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  48.86 
 
 
264 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  45.38 
 
 
254 aa  226  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
252 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  46.21 
 
 
264 aa  224  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 
245 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.68 
 
 
254 aa  218  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.22 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  40.94 
 
 
251 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.81 
 
 
251 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
253 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.21 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 
375 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
325 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.62 
 
 
252 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 
347 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  34.8 
 
 
356 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  34.07 
 
 
343 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  31.9 
 
 
224 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
381 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.49 
 
 
377 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  36.67 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.49 
 
 
400 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.9 
 
 
377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 
385 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  36.8 
 
 
243 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  34.8 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  32.05 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.03 
 
 
375 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  31.72 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  35.07 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  30.8 
 
 
333 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.75 
 
 
385 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>