More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3374 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  81.91 
 
 
398 aa  644  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
398 aa  784  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.27195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  78.43 
 
 
399 aa  624  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.25853e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  78.43 
 
 
399 aa  624  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.23204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  78.17 
 
 
399 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.14177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  78.23 
 
 
399 aa  620  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.59613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  78.17 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  78.17 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.22558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  78.17 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.80591e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  78.17 
 
 
399 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  77.92 
 
 
399 aa  618  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  77.66 
 
 
399 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.69498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  75.89 
 
 
399 aa  614  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 
451 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 
404 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  46.35 
 
 
447 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  49.88 
 
 
438 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  47.11 
 
 
477 aa  356  4e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 
447 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
473 aa  335  6e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 
445 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 
435 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  41.54 
 
 
388 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  42.14 
 
 
382 aa  301  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  47.34 
 
 
449 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  42.69 
 
 
381 aa  294  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  9.14056e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  39.01 
 
 
459 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
451 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  37.23 
 
 
474 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
472 aa  275  1e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  36.01 
 
 
473 aa  275  1e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  36.25 
 
 
474 aa  273  5e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  36.01 
 
 
474 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.01 
 
 
472 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  36.01 
 
 
474 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.56 
 
 
459 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  34.34 
 
 
455 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  34.57 
 
 
455 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  36.04 
 
 
473 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  35.1 
 
 
478 aa  259  5e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.1 
 
 
457 aa  259  5e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  35.1 
 
 
478 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  35.1 
 
 
478 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  35.1 
 
 
478 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  34.62 
 
 
478 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  35.1 
 
 
478 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
451 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  34.86 
 
 
478 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.31 
 
 
476 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
456 aa  254  1e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  41.53 
 
 
382 aa  255  1e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  43.02 
 
 
372 aa  254  1e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  1.41049e-07 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  36.01 
 
 
467 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  35.45 
 
 
415 aa  249  8e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  34.22 
 
 
509 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  33.49 
 
 
456 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 
465 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  37.47 
 
 
424 aa  240  3e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
380 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  35.48 
 
 
436 aa  234  1e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  37.93 
 
 
436 aa  234  2e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  38.74 
 
 
422 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  35.24 
 
 
436 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
470 aa  232  8e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.62 
 
 
526 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  36.79 
 
 
436 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.46 
 
 
437 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  38.5 
 
 
422 aa  229  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.98 
 
 
438 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.74 
 
 
438 aa  226  5e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  34.92 
 
 
437 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  31.16 
 
 
514 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.18 
 
 
468 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.98546e-05  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  33.8 
 
 
464 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
450 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.74507e-10 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.33 
 
 
398 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  34.06 
 
 
422 aa  202  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  34.54 
 
 
469 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  32.87 
 
 
450 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 
539 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  49.51 
 
 
485 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.38 
 
 
451 aa  182  8e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
447 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.98 
 
 
409 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.05 
 
 
409 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.98 
 
 
409 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.82 
 
 
434 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  32.7 
 
 
411 aa  175  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
446 aa  173  4e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  31.03 
 
 
429 aa  172  6e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.88 
 
 
435 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.39 
 
 
418 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  28.18 
 
 
456 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
459 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.2 
 
 
429 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.68 
 
 
434 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.08 
 
 
432 aa  167  3e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  31.49 
 
 
435 aa  167  3e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.68 
 
 
434 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  26.35 
 
 
452 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>