More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0152 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  100 
 
 
253 aa  517  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  74.8 
 
 
251 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  56.52 
 
 
254 aa  304  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  56.52 
 
 
254 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  56.13 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  56.13 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  56.13 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  56.13 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  56.13 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  54.94 
 
 
254 aa  299  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  54.72 
 
 
258 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  54.94 
 
 
254 aa  298  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  54.15 
 
 
254 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  44.98 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  44.44 
 
 
250 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
251 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 
248 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.82 
 
 
244 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  42.36 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
238 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
256 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 
263 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38 
 
 
251 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  36.73 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 
241 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  33.9 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 
220 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  31.91 
 
 
235 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.63 
 
 
244 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  30.57 
 
 
259 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  32.5 
 
 
258 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  38.83 
 
 
213 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  38.3 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.77 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  33.17 
 
 
321 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  29.81 
 
 
299 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.22 
 
 
404 aa  121  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
337 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
228 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 
324 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  29.95 
 
 
327 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
320 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 
299 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  28.97 
 
 
299 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  28.97 
 
 
299 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  31.92 
 
 
320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 
292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.83 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
276 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
413 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
291 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
294 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 
352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 
199 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
275 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
405 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 
275 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.03 
 
 
275 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 
277 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
372 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.68 
 
 
271 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32 
 
 
267 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  29.1 
 
 
258 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.15 
 
 
279 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.35 
 
 
265 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 
430 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  29.85 
 
 
265 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 
247 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 
302 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  33.82 
 
 
238 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1728  polysaccharide deacetylase family protein  33.33 
 
 
238 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.5 
 
 
260 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 
215 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>