More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0046 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
272 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0047  UbiA prenyltransferase  87.21 
 
 
258 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0223  protoheme IX farnesyl transferase, putative  50.59 
 
 
270 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  49.81 
 
 
271 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  36.09 
 
 
298 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0532  UbiA prenyltransferase  40.22 
 
 
346 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  37.57 
 
 
295 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0901  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 
298 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0391219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0950  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
298 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0952  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
298 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 
321 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2530  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  39.81 
 
 
276 aa  111  1e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0946  protoheme IX farnesyltransferase  41.71 
 
 
296 aa  110  2e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.660231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 
326 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 
305 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1827  protoheme IX farnesyltransferase, putative  35.44 
 
 
282 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000128435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 
317 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  35.79 
 
 
297 aa  108  7e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  32.77 
 
 
286 aa  108  8e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 
315 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 
341 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 
294 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 
328 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 
328 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87130  predicted protein  36.6 
 
 
363 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  9.07307e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1349  UbiA prenyltransferase  37.85 
 
 
287 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 
312 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  38.55 
 
 
310 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 
353 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 
312 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.55 
 
 
302 aa  103  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 
309 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.3 
 
 
310 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 
310 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 
310 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 
301 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36.31 
 
 
302 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  34.87 
 
 
315 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  4.91835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  38.82 
 
 
300 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  33.82 
 
 
300 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  32.74 
 
 
308 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 
315 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 
315 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  33.99 
 
 
300 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 
301 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  30.08 
 
 
300 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  35.05 
 
 
313 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  38.62 
 
 
342 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 
307 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 
301 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  32.51 
 
 
303 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  31.75 
 
 
297 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 
342 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 
310 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  28.41 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  36.78 
 
 
325 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  30.08 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  31.44 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  3.48808e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
302 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  37.73 
 
 
339 aa  98.6  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  35.36 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  36.57 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  28.68 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  30.71 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  33.71 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  32.59 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  34.38 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  32.59 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  37.57 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.48066e-06  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  37.17 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 
622 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  32.98 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.32 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  30.7 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  39.11 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  34.52 
 
 
319 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54836e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  33.51 
 
 
313 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.12 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  34.44 
 
 
317 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  35.67 
 
 
326 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  31.98 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.24 
 
 
324 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  42 
 
 
304 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  34.44 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 
328 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37.65 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32550  predicted protein  30.08 
 
 
393 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  34.44 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>