189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1818 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1818  electron transport complex protein RnfD  100 
 
 
350 aa  702  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452065  decreased coverage  0.000391515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01600  electron transport complex protein RnfD  85.43 
 
 
352 aa  612  1e-174  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2342  electron transport complex protein RnfD  85.43 
 
 
352 aa  613  1e-174  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0357526  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1838  electron transport complex protein RnfD  85.14 
 
 
352 aa  611  1e-174  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00396997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1706  electron transport complex protein RnfD  85.14 
 
 
352 aa  610  1e-174  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1999  electron transport complex protein RnfD  85.14 
 
 
352 aa  611  1e-174  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00297126  normal  0.240124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01590  hypothetical protein  85.43 
 
 
352 aa  612  1e-174  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0216636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2011  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  85.14 
 
 
352 aa  610  1e-174  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1569  electron transport complex protein RnfD  84.57 
 
 
352 aa  607  1e-172  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.08013  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1819  electron transport complex protein RnfD  84.57 
 
 
352 aa  607  1e-172  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1566  electron transport complex protein RnfD  83.14 
 
 
352 aa  581  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.094034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1554  electron transport complex protein RnfD  83.14 
 
 
352 aa  581  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.52008  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1718  electron transport complex protein RnfD  83.14 
 
 
352 aa  581  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1626  electron transport complex protein RnfD  83.14 
 
 
352 aa  581  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  0.410442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1886  electron transport complex protein RnfD  82.86 
 
 
352 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115078  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2022  electron transport complex protein RnfD  69.14 
 
 
351 aa  493  1e-138  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2322  electron transport complex protein RnfD  67.71 
 
 
351 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  67.24 
 
 
361 aa  484  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  4.30242e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2010  electron transport complex protein RnfD  68.1 
 
 
364 aa  466  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.079391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2250  electron transport complex protein RnfD  67.82 
 
 
364 aa  464  1e-130  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.98545e-05  normal  0.637976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1898  electron transport complex protein RnfD  68.59 
 
 
351 aa  466  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000890803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  64.86 
 
 
350 aa  445  1e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1919  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  63.17 
 
 
353 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002946  electron transport complex protein RnfD  58.45 
 
 
348 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  57.02 
 
 
349 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  57.31 
 
 
349 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  57.31 
 
 
349 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  57.31 
 
 
349 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2041  electron transport complex protein RnfD  57.14 
 
 
350 aa  400  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.460383  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  56.16 
 
 
349 aa  398  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.41791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2196  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  56.73 
 
 
353 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  55.3 
 
 
349 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  55.01 
 
 
349 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0535  electron transport complex protein RnfD  57.88 
 
 
348 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  55.3 
 
 
349 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  55.01 
 
 
349 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  55.01 
 
 
349 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1833  electron transport complex protein RnfD  57.43 
 
 
348 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.457327  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2559  electron transport complex protein RnfD  54.29 
 
 
350 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2175  electron transport complex protein RnfD  53.71 
 
 
350 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.164146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2968  electron transport complex protein RnfD  53.3 
 
 
357 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  57.14 
 
 
328 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  53.54 
 
 
350 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1869  electron transport complex protein RnfD  58.86 
 
 
351 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1866  electron transport complex protein RnfD  55.71 
 
 
350 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2356  electron transport complex protein RnfD  53.43 
 
 
350 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2069  electron transport complex protein RnfD  54.29 
 
 
350 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1062  electron transport complex protein RnfD  52.79 
 
 
363 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02732  electron transport complex protein RnfD  54.35 
 
 
342 aa  357  2e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2896  electron transport complex, D subunit  54.73 
 
 
343 aa  355  6e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2629  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  47.71 
 
 
352 aa  327  2e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  49.86 
 
 
350 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1172  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  51.14 
 
 
345 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2403  electron transport complex protein RnfD  48.59 
 
 
357 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.469732  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1542  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  47.44 
 
 
352 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.142338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  49 
 
 
338 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1784  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.15 
 
 
349 aa  311  7e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  49.42 
 
 
343 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1401  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  49.28 
 
 
343 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.06 
 
 
343 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  43.31 
 
 
338 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1793  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.99 
 
 
353 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18910  hypothetical protein  48.15 
 
 
344 aa  283  3e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00596612  normal  0.053372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1637  hypothetical protein  49 
 
 
344 aa  282  5e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  41.85 
 
 
359 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2018  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.2 
 
 
342 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4510  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  42.94 
 
 
327 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000355636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  42.9 
 
 
366 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0262  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfD subunit-like  39.71 
 
 
334 aa  234  2e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.29 
 
 
357 aa  234  2e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3195  RnfD protein  40.62 
 
 
362 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3934  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.57 
 
 
362 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00796702  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.56 
 
 
355 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0286  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.66 
 
 
357 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364924  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.86 
 
 
360 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0813  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  43.6 
 
 
313 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337614  normal  0.474705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2992  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.99 
 
 
357 aa  216  3e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0388  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.6 
 
 
325 aa  199  4e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1124  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.1 
 
 
327 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.33 
 
 
324 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.92 
 
 
318 aa  197  2e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.92 
 
 
318 aa  197  2e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.45 
 
 
307 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.23733e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.05 
 
 
318 aa  192  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1135  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  42.9 
 
 
323 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.23 
 
 
330 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1095  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  43.81 
 
 
323 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.62 
 
 
335 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.65 
 
 
326 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0307  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.48 
 
 
337 aa  183  4e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0928728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.96 
 
 
327 aa  182  9e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.06 
 
 
321 aa  182  9e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.88 
 
 
315 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4317  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.11 
 
 
324 aa  175  1e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.9 
 
 
325 aa  175  1e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.45207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.91 
 
 
324 aa  174  2e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0343  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.96 
 
 
315 aa  174  3e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.84 
 
 
318 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1530  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.72 
 
 
331 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0274515  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0212  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.24 
 
 
336 aa  166  6e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0013917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>