82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0776 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  100 
 
 
326 aa  649    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  56.48 
 
 
388 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  52.63 
 
 
392 aa  335  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  51.52 
 
 
386 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  50.31 
 
 
394 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  48.65 
 
 
393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  49.85 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  48.22 
 
 
414 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  48.63 
 
 
394 aa  291  9e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 
393 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  44.86 
 
 
408 aa  282  7.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  46.56 
 
 
389 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  41.54 
 
 
390 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  34.46 
 
 
395 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
425 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  28.21 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
407 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  27.95 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.4 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.53 
 
 
395 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.96 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.26 
 
 
415 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.67 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.11 
 
 
398 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.2 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.71 
 
 
505 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  25.88 
 
 
396 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  25.65 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  25.74 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.18 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.18 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  25 
 
 
415 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
405 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.18 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
377 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
370 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.87 
 
 
384 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  28.91 
 
 
414 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  25.46 
 
 
392 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  24.84 
 
 
387 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  23.35 
 
 
467 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  23.35 
 
 
467 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  23.35 
 
 
467 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  26.62 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  25.49 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
529 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  24.72 
 
 
433 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  23.35 
 
 
467 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  21.65 
 
 
401 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  20.94 
 
 
440 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  24.26 
 
 
437 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  25.16 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  25.16 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  25.16 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  25.16 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  25.16 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.57 
 
 
405 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  25.16 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.35 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  21.53 
 
 
406 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.44 
 
 
385 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.44 
 
 
385 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
421 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  23.88 
 
 
385 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.29 
 
 
432 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
394 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.29 
 
 
432 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  21.77 
 
 
406 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 
406 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  25.76 
 
 
374 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.08 
 
 
433 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>