186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0265 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  99.16 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  40.1 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  39.58 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.77 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  37.2 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  35.81 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  37 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  36.63 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  35.86 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  31.75 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  31.77 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  27.14 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  28.64 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  28.06 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  28.08 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  30.73 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  25.52 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  29.15 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  29.15 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  28.38 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  27.68 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  24.78 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  25.89 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  27.67 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  25.63 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  25.51 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  25.4 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  26.9 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  23.86 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  27.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  23.16 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  25.34 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  62.86 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  29.38 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  62.86 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  43.66 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  27.31 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  28.32 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  28.32 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  62.86 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  23.71 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  40.28 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  27.15 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  28.32 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  27.88 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  34.82 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  29.63 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  27.52 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  25.45 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  25.5 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  26.11 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  33.73 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  50 
 
 		 144 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  28.3 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0971  flagellar hook capping protein  33.75 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  30.86 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  25.24 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  26.87 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  25.31 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  23.78 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  28.08 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  25.2 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  24.74 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  26.87 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  24.74 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  26.14 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  39.44 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  25.49 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  51.06 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  25.64 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  21.61 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  25.49 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  31.65 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  42.19 
 
 		 138 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  28.32 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  26.26 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  47.92 
 
 		 137 aa  49.3  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  25.24 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  47.92 
 
 		 137 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  29.79 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  45.83 
 
 		 136 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>