More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0047 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  99.77 
 
 
443 aa  884  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
443 aa  884  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  99.77 
 
 
443 aa  884  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  99.55 
 
 
443 aa  882  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  86.1 
 
 
468 aa  761  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  69.77 
 
 
452 aa  646  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  86.1 
 
 
468 aa  762  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  99.32 
 
 
443 aa  880  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  99.77 
 
 
443 aa  884  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  86.1 
 
 
468 aa  761  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  85.88 
 
 
468 aa  761  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  85.88 
 
 
468 aa  761  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  68.28 
 
 
445 aa  637  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  99.77 
 
 
443 aa  884  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  100 
 
 
443 aa  885  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  67.36 
 
 
438 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  61.42 
 
 
458 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  50.81 
 
 
480 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  42.92 
 
 
464 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  42.89 
 
 
446 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  38.55 
 
 
442 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  38.44 
 
 
443 aa  285  1e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  39.14 
 
 
442 aa  285  2e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
460 aa  275  1e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  38.91 
 
 
442 aa  272  8e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  37.35 
 
 
457 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  34.8 
 
 
453 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  36.74 
 
 
452 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  36.74 
 
 
452 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  36.74 
 
 
452 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  34.29 
 
 
439 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  34.34 
 
 
445 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  34.34 
 
 
445 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  34.34 
 
 
445 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  34.34 
 
 
445 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  34.34 
 
 
445 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  34.34 
 
 
445 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
469 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  34.34 
 
 
445 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  33.96 
 
 
441 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  34.11 
 
 
457 aa  220  4e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  33.03 
 
 
468 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  27.31 
 
 
447 aa  180  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.66 
 
 
427 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  28.44 
 
 
434 aa  173  7e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.83 
 
 
465 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
465 aa  172  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
423 aa  163  5e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.39 
 
 
476 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  32.94 
 
 
458 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  28.19 
 
 
471 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  32.94 
 
 
458 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.95 
 
 
463 aa  149  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.87 
 
 
459 aa  149  1e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  25.84 
 
 
469 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  27.42 
 
 
457 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  28.18 
 
 
443 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.67 
 
 
454 aa  143  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  29.27 
 
 
477 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  28.18 
 
 
441 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.68 
 
 
471 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  27 
 
 
475 aa  140  5e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.62 
 
 
465 aa  140  5e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.06 
 
 
457 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25 
 
 
467 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
474 aa  136  6e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
508 aa  136  7e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.5 
 
 
480 aa  135  1e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.31 
 
 
448 aa  135  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.11 
 
 
499 aa  136  1e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.5 
 
 
477 aa  135  2e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.29 
 
 
472 aa  131  2e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.43 
 
 
471 aa  131  2e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.49242e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.94 
 
 
446 aa  131  2e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  26.77 
 
 
442 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  26.77 
 
 
442 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.72 
 
 
441 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  27.07 
 
 
442 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.58 
 
 
475 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.82 
 
 
475 aa  129  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
451 aa  128  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.82 
 
 
475 aa  129  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
451 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  27.58 
 
 
475 aa  127  4e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26 
 
 
474 aa  127  4e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  28.85 
 
 
472 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.71 
 
 
493 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.42 
 
 
450 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.63 
 
 
463 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.42 
 
 
450 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.83 
 
 
479 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
435 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
456 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
489 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  27.72 
 
 
489 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25.16 
 
 
455 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 
489 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  26.83 
 
 
489 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.55 
 
 
455 aa  121  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.93 
 
 
449 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>