59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0617 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  62.85 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  55.3 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  37.34 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  37.34 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  30.43 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.63 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  35.71 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.21 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.91 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.91 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.69 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  33.33 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.69 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.51 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  29.09 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  34.31 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  30.23 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  34.33 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  31.43 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.3 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  31.51 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  34.07 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.26 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.86 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.39 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.28 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  25.56 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.51 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  31.71 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  33.68 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  27.59 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  31.31 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  26 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.51 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.46 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.41 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  26.77 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  29.36 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  26.94 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  31.54 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  26.27 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  27.41 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  27.7 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  23.96 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  26.28 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  23.83 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  31.11 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  31.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.74 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>