148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1086 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  48.33 
 
 
181 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  46.2 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  44.25 
 
 
185 aa  168  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  40.76 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.2 
 
 
186 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  41.81 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  40.44 
 
 
196 aa  120  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  37.93 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.22 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  42.86 
 
 
187 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  35.03 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  35.03 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  35.03 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.15 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.88 
 
 
187 aa  111  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  33.33 
 
 
183 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  36.26 
 
 
181 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  33.15 
 
 
183 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  33.53 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  33.33 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  29.89 
 
 
183 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  31.52 
 
 
183 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  34.83 
 
 
186 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  35.26 
 
 
188 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  32.37 
 
 
183 aa  104  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  32.37 
 
 
183 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  30.43 
 
 
185 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  32.22 
 
 
178 aa  97.8  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  32.02 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.49 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.9 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  35.8 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  32.62 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  34.64 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  34.64 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  34.64 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  32.4 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  31.18 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  30.77 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.96 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.25 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.23 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  34.5 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.29 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  33.9 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  29.09 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.91 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  28.82 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  26.55 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.48 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.97 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.38 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.57 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  32.75 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.92 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.51 
 
 
219 aa  52.4  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  27.32 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  26.88 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.17 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  27.98 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  28.19 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  25.9 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.95 
 
 
165 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  25.77 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.28 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  28.24 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  26.38 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  26.38 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  25.83 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.93 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  29.27 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  23.98 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  23.86 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  26.85 
 
 
160 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.29 
 
 
150 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  25.86 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  25.64 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  25.16 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3460  phosphoesterase  25.54 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  23.5 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.33 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>