95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1065 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  100 
 
 		 701 aa  1437    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  55.71 
 
 		 895 aa  741    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  40.6 
 
 		 862 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  39.25 
 
 		 843 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  29.43 
 
 		 863 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  29.44 
 
 		 867 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  29.69 
 
 		 868 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  25.43 
 
 		 820 aa  203  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  28.13 
 
 		 878 aa  203  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  22.33 
 
 		 903 aa  138  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  24.55 
 
 		 871 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  23.34 
 
 		 919 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 868 aa  104  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  24.8 
 
 		 612 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 567 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 520 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.81 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.89 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4964  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 571 aa  55.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 549 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.23 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 528 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 622 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 529 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 526 aa  51.2  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.15 
 
 		 520 aa  50.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 507 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.49 
 
 		 545 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.37 
 
 		 535 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 534 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 638 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 528 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  30.4 
 
 		 549 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 		 533 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 618 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 539 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 566 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0664  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 568 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  19.42 
 
 		 532 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 578 aa  47.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 532 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.7 
 
 		 532 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  25.28 
 
 		 571 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 531 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  19.47 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3602  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.9 
 
 		 568 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 521 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 530 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3271  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3645  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.65 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 527 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3379  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.65 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 534 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 503 aa  45.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 592 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 535 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3602  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.91 
 
 		 568 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 535 aa  45.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 507 aa  45.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  47.27 
 
 		 198 aa  45.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  21.5 
 
 		 566 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3378  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 568 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 520 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1732  oligopeptide ABC transporter solute binding protein  23.14 
 
 		 519 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  42.86 
 
 		 516 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3644  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.53 
 
 		 568 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.257621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3293  ABC transporter substrate-binding protein  22.33 
 
 		 567 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00121991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27800  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.05 
 
 		 528 aa  44.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1621  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.33 
 
 		 567 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00066622  hitchhiker  0.00438067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 552 aa  44.3  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1709  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  23.14 
 
 		 542 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 528 aa  44.3  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 528 aa  44.3  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 536 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 564 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 617 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0935  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 533 aa  43.9  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 544 aa  43.9  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 531 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 542 aa  43.9  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1726  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 542 aa  43.9  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00443196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>