More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0663 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
338 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 
340 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 
337 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 
337 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
339 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 
341 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 
368 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 
341 aa  208  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 
344 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 
333 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 
335 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.74 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 
386 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 
343 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 
339 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 
351 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
336 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 
337 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  35.33 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.22 
 
 
330 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 
355 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
338 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 
333 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 
340 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 
343 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 
348 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  30.65 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  32.42 
 
 
338 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  33.04 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 
339 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 
337 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
340 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
348 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 
336 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 
340 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
473 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.87 
 
 
333 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 
343 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  33.43 
 
 
339 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 
344 aa  178  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 
352 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  32.06 
 
 
384 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.53 
 
 
332 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.12 
 
 
335 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 
335 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
342 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.35 
 
 
336 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 
343 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 
332 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 
338 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  32.94 
 
 
367 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 
346 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 
347 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 
338 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.8 
 
 
347 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 
351 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 
346 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 
359 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1653  HTH-type transcriptional regulator  30.28 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117705  hitchhiker  0.0000123229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3308  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.608255  normal  0.781204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.55 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.66 
 
 
330 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.08 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.83 
 
 
338 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  31.66 
 
 
332 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  32.12 
 
 
361 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 
336 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 
345 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  36.22 
 
 
330 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 
340 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.780097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>