69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0059 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0059  protein of unknown function DUF48  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3119  CRISPR-associated protein Cas1  40.86 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4488  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.5 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.116013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1030  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.19 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0344  CRISPR-associated protein Cas1  38.78 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0826483  normal  0.0182764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1231  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.22 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1695  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.14 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1874  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.66 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0244  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.14 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0710  hypothetical protein  31.1 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0265881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0098  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.26 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1062  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2463  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.7 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0610401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1950  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.47 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0401  CRISPR-associated protein Cas1  34.8 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0328  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.47 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0955  hypothetical protein  40.09 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.323915  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf598  hypothetical protein  31.34 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0895  lipoyl-binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1476  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.59 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.095696  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2009  CRISPR-associated protein Cas1  23.94 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.515668  normal  0.104859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1903  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0451  hypothetical protein  36.28 
 
 		 114 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.89 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  25.26 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  31.13 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.41 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0450  hypothetical protein  25.93 
 
 		 173 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146666  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0578  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.04 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0010415  normal  0.0764761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.98 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  25.11 
 
 		 727 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.28 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  23.23 
 
 		 336 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.12 
 
 		 731 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.35 
 
 		 402 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.35 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.61 
 
 		 570 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.61 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.5 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.6 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.89 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.48 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1982  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.43 
 
 		 1031 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.66 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  21.58 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1140  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.59 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.511238  hitchhiker  0.00000356789 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  35.9 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  27.08 
 
 		 344 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 731 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.36 
 
 		 580 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.34 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  37.78 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.71 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  26.07 
 
 		 594 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.14 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.46 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  26.51 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.97 
 
 		 598 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  26.85 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  39.66 
 
 		 558 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.71 
 
 		 553 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  38.71 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  36.11 
 
 		 404 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.22 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  30.11 
 
 		 207 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  25.42 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  22.55 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>