285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3338 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  43.46 
 
 
286 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  41.7 
 
 
274 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  40.67 
 
 
304 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  42.69 
 
 
273 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  36.79 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.82 
 
 
317 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 
288 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
274 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
277 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  32.81 
 
 
274 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 
277 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.71 
 
 
272 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
273 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
283 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
288 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
274 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 
283 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
276 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
283 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 
288 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
286 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
283 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
257 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
315 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 
275 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 
288 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 
251 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 
299 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
249 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
249 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 
296 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
274 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 
249 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
283 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  34.2 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  37.9 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 
310 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 
359 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>