More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2972 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
447 aa  923    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  54 
 
 
445 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  51.15 
 
 
443 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  46.42 
 
 
442 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  44.73 
 
 
453 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  46.9 
 
 
445 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  37.47 
 
 
474 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.18 
 
 
436 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
427 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 
489 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.65 
 
 
424 aa  159  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
492 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  39.11 
 
 
489 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.01 
 
 
489 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  38.31 
 
 
489 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 
424 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  36.8 
 
 
493 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.63 
 
 
423 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  34.47 
 
 
529 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  39.65 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  36.59 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  35.52 
 
 
513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.25 
 
 
490 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  35.25 
 
 
479 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  34.96 
 
 
479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
504 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.94 
 
 
264 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
392 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 
284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.17 
 
 
365 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 
278 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.07 
 
 
268 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.78 
 
 
294 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  36.28 
 
 
282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.67 
 
 
479 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  27.86 
 
 
562 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  34.58 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
487 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
278 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  32.24 
 
 
285 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
481 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 
550 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 
320 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.35 
 
 
279 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.35 
 
 
279 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  25.49 
 
 
484 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
604 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 
488 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 
292 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  31.94 
 
 
640 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 
474 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30.62 
 
 
566 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 
270 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
483 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
315 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
479 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  25.12 
 
 
484 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 
479 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 
280 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 
487 aa  100  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.22 
 
 
262 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 
567 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.87 
 
 
561 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 
292 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  30 
 
 
568 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.85 
 
 
500 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.28 
 
 
480 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  31.27 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  29.92 
 
 
484 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.6 
 
 
483 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
605 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
569 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  28.52 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
528 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 
565 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 
554 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  30.39 
 
 
351 aa  97.8  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  31.1 
 
 
533 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 
289 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  33.17 
 
 
470 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.22 
 
 
473 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 
632 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
284 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.53 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.87 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 
247 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 
493 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 
267 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 
632 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  29.5 
 
 
275 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 
286 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  25 
 
 
494 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.27 
 
 
494 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.43 
 
 
524 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  24.27 
 
 
483 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.14 
 
 
483 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>