275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0014 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  100 
 
 
450 aa  909  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  46.54 
 
 
442 aa  407  1e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  44.9 
 
 
460 aa  328  1e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  35.8 
 
 
449 aa  275  1e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  36.87 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  36.09 
 
 
479 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  36.48 
 
 
446 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.20999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  35.57 
 
 
446 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74757e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  38.86 
 
 
417 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  33.92 
 
 
397 aa  233  4e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  38.9 
 
 
425 aa  219  8e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  32.74 
 
 
411 aa  214  2e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  31.78 
 
 
473 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  33.59 
 
 
439 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  32.68 
 
 
452 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  31.36 
 
 
451 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  32.33 
 
 
447 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  30.77 
 
 
561 aa  175  1e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  28.78 
 
 
424 aa  175  1e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  28.86 
 
 
487 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  30.08 
 
 
459 aa  167  3e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  26.5 
 
 
405 aa  166  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  30.44 
 
 
422 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  29.38 
 
 
472 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  30.38 
 
 
499 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  29.17 
 
 
434 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  30.94 
 
 
430 aa  129  1e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  37.64 
 
 
286 aa  127  4e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  32.82 
 
 
408 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  28.45 
 
 
451 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  29.55 
 
 
443 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  31.9 
 
 
439 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  31.85 
 
 
442 aa  122  1e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  31.85 
 
 
442 aa  122  1e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.77 
 
 
437 aa  122  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  31.7 
 
 
442 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  32.32 
 
 
442 aa  121  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  32.96 
 
 
443 aa  122  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.49 
 
 
437 aa  121  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  32.96 
 
 
443 aa  122  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.49 
 
 
437 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.49 
 
 
437 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.49 
 
 
437 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.49 
 
 
437 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  30.63 
 
 
433 aa  118  2e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  1.15397e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  30.94 
 
 
437 aa  118  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  31.6 
 
 
439 aa  119  2e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  31.14 
 
 
405 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  28.49 
 
 
436 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  28.49 
 
 
436 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  29.06 
 
 
429 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  32.46 
 
 
411 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  30.94 
 
 
436 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  29.13 
 
 
439 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  31.72 
 
 
411 aa  115  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  29.72 
 
 
412 aa  115  2e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.52 
 
 
447 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.37 
 
 
412 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 
538 aa  111  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.3 
 
 
285 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  27.4 
 
 
443 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27.91 
 
 
441 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  30.77 
 
 
443 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  28.4 
 
 
337 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.99 
 
 
337 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.74 
 
 
323 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.74 
 
 
323 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.74 
 
 
323 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.06 
 
 
336 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  27.37 
 
 
323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  30.38 
 
 
444 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  27.67 
 
 
337 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.13 
 
 
298 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  1.33239e-07 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.78 
 
 
525 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.84 
 
 
295 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  26.91 
 
 
525 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  28.62 
 
 
294 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  30.12 
 
 
275 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  27.82 
 
 
288 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.42 
 
 
294 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0409  hypothetical protein  22.25 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.521207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.79 
 
 
340 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27.17 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2564  ribonuclease BN  24.13 
 
 
541 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.110127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.66 
 
 
296 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  9.22798e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.91 
 
 
297 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.45 
 
 
320 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  28.57 
 
 
313 aa  94  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  27.43 
 
 
445 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  28.21 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  28.24 
 
 
290 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  27.04 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  28.24 
 
 
290 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  32.02 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  28.24 
 
 
290 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  28.24 
 
 
290 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  26.71 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  28.24 
 
 
290 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  29.02 
 
 
290 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  27.04 
 
 
294 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>