36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0409 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0409  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  847    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.521207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  22.49 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  20.94 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  22.8 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  20.06 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  22.78 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  23.64 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  20.71 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  22.05 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  23.95 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  21 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  20.83 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  22.15 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  20.88 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  20.8 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  21.71 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  20.75 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  22.03 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  20.73 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  21.29 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  21.56 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  21.52 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  22.48 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  21.33 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  19.74 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.49 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  19.38 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  20.93 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  20.79 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  22.44 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  21.96 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  31.17 
 
 		 286 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  18.34 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>