198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_142 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  87.77 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  85.61 
 
 		 139 aa  242  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  43.27 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  54.69 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  45.92 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.42 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.24 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  36.25 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  41.51 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  38.24 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  32.95 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  32.56 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.92 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  42.86 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  44.23 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  35.14 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  39.39 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  38.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.31 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  39.22 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  41.67 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  38.89 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.54 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  26.98 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  31.67 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  31.67 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  30.71 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  33.33 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  40.43 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  45.83 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.98 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  35.71 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  44.23 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  40.43 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.55 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  31.58 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  29.29 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  46.34 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  40.43 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  33.77 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  39.73 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0384  general secretion pathway protein G  28.17 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  29.1 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.34 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>