More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2540 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  47.4 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  48.37 
 
 		 246 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  46.56 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  47.59 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 264 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 276 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 276 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  46.45 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  45.31 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  44.97 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  44.79 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  44.79 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  45.36 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  46.7 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  40.83 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  41.76 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  38.71 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.73 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.73 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  34.81 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.79 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.04 
 
 		 233 aa  97.8  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  35.68 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  38.22 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 270 aa  94.7  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.47 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.56 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.56 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.47 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.02 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.47 
 
 		 222 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.02 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.02 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.88 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.8 
 
 		 244 aa  92.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  35.88 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  40 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5945  ABC transporter related  41.62 
 
 		 580 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  39.15 
 
 		 255 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  40.22 
 
 		 259 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  33.72 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  30.41 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  35.14 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  41.44 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  35.87 
 
 		 360 aa  88.6  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 255 aa  88.6  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  34.41 
 
 		 258 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  37.84 
 
 		 249 aa  88.2  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.73 
 
 		 212 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  38.82 
 
 		 264 aa  88.2  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  34.09 
 
 		 227 aa  88.2  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 255 aa  88.2  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  31.94 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  39.01 
 
 		 277 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 242 aa  87.8  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  35.9 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  36.36 
 
 		 261 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  86.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  37.76 
 
 		 243 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  34.05 
 
 		 566 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  38.46 
 
 		 263 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  40.4 
 
 		 260 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  35.91 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 381 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  36.22 
 
 		 265 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16991  ABC transporter, ATP binding component, glycine betaine/proline family protein  35.53 
 
 		 383 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 		 322 aa  85.5  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 253 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  35.35 
 
 		 245 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1026  ABC transporter related  30.57 
 
 		 251 aa  85.1  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.32 
 
 		 510 aa  85.1  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 244 aa  85.1  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 262 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  37.57 
 
 		 246 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 374 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  38.02 
 
 		 246 aa  84.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1427  ABC transporter related  37.91 
 
 		 278 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0305072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  32.79 
 
 		 252 aa  84.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>