More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0699 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  96.88 
 
 
224 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  75.45 
 
 
230 aa  329  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  58.64 
 
 
246 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  58.45 
 
 
242 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  58.72 
 
 
233 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  57.34 
 
 
242 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  58.26 
 
 
233 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  58.26 
 
 
233 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  58.26 
 
 
233 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  58.72 
 
 
233 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  56.88 
 
 
233 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  58.26 
 
 
266 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
231 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
264 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
276 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
231 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
231 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 
231 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  54.95 
 
 
276 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
192 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  44.38 
 
 
221 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  43.33 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.81 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.81 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.31 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.31 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.81 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  38.3 
 
 
225 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.3 
 
 
225 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.3 
 
 
225 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 
362 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  38.24 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.77 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.77 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.1 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  37.77 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.77 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  34 
 
 
352 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.23 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.22 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.33 
 
 
244 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.71 
 
 
233 aa  108  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.1 
 
 
255 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.7 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  33.49 
 
 
360 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
249 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  32.89 
 
 
241 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  33.18 
 
 
258 aa  104  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  33.5 
 
 
255 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  33.01 
 
 
222 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
251 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  35.71 
 
 
213 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  39.2 
 
 
244 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.31 
 
 
256 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 
251 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  40.31 
 
 
199 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  39.59 
 
 
277 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
216 aa  101  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  37.21 
 
 
256 aa  101  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  36.87 
 
 
242 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  36.63 
 
 
259 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
251 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.55 
 
 
216 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.06 
 
 
260 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.06 
 
 
376 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.43 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 
297 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
240 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.58 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.58 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  36.93 
 
 
213 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  98.6  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  36.49 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
279 aa  98.2  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  33.96 
 
 
358 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  33.81 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.1 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000942393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  35.07 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  39.18 
 
 
251 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  42.49 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  30.14 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>