More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1427 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1427  ABC transporter related  100 
 
 
278 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0305072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1827  ABC transporter related protein  85.61 
 
 
272 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2222  ABC transporter related  51.14 
 
 
272 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2740  ABC transporter-related protein  50.95 
 
 
260 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  40.17 
 
 
249 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.26 
 
 
322 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.03 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.52 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  42.24 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.22 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  32.7 
 
 
308 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
264 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
388 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  40.17 
 
 
536 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
443 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 
329 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  39.47 
 
 
330 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
329 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  38.46 
 
 
250 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 
478 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  36.17 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.97 
 
 
454 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1020  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113907  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
337 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  37.1 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4687  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.83 
 
 
317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.17 
 
 
337 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  36.29 
 
 
270 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
539 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  40.09 
 
 
545 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2754  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 
602 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  38.16 
 
 
555 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  39.53 
 
 
577 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  43.87 
 
 
249 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.92 
 
 
325 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
311 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  36.17 
 
 
308 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.53 
 
 
346 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  38.03 
 
 
505 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
292 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  39.5 
 
 
588 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0730  ABC transporter related  40.79 
 
 
285 aa  161  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4408  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 
333 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.44 
 
 
555 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.48 
 
 
339 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  39.17 
 
 
268 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2029  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  35.32 
 
 
319 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3421  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.61 
 
 
369 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  37.72 
 
 
555 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4791  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 
317 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28753  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 
332 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  38.49 
 
 
552 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 
539 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
334 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.91 
 
 
273 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4501  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229817 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 
276 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
322 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
338 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.82 
 
 
627 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  42.08 
 
 
249 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
349 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  35.47 
 
 
313 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.3 
 
 
445 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  39.18 
 
 
563 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  37.5 
 
 
551 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0546481 
 
 
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NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  37.61 
 
 
556 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  35.47 
 
 
313 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_2962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
342 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_5402  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
338 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013743  Htur_3696  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
447 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 
690 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.5 
 
 
326 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136668  normal 
 
 
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NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  34.87 
 
 
282 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
282 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.98 
 
 
566 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
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NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.36 
 
 
665 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
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NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
326 aa  158  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  40.25 
 
 
556 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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